Els Projectes Transversals d'EducaPax desenvolupen tres propostes d'aplicació directa i global per a totes les etapes i centres educatius, sota el nom de: (1) Aules SILENT (basades en la immersió en el Silenci, l'educació de la Lentitud i la Recerca Vital), (2) Escoles Noviolentes (projecte educatiu integral que ofereix crear o consolidar una 'cultura noviolenta escolar' per a tota la comunitat educativa) i (3) Activisme Escolar (que pretén abocar l'alumnat en l'aprenenatatge-servei dins del centre educatiu però també obrint-se a la societat).